Selección genómica en ponedoras y crías de pollos de engorde (Parte 2)



Prueba de concepto



Para verificar si la expectativa de una mayor ganancia genética mediante el uso de la información genómica era factible, la universidad estatal de Iowa y Hy-Line International (Wolc et al., 2011) diseñó un experimento de selección. Se dividió una línea pura de gallinas ponedoras marrones en dos sublíneas y por un período de 3 años se seleccionó una de las líneas a la edad habitual, basándose en las predicciones convencionales en pedigrí y la otra línea se sometió a la selección temprana a base a predicciones genómicas. El índice de selección contenía 16 rasgos de producción y calidad de huevo y, fueron usados para seleccionar criadores empleando datos tradicionales de fenotípica / pedigrí (basado en resultados de rendimiento individuales y familiares) o selección genómica, usando datos genómicos y fenotípicos. Antes de iniciar la comparación, los criterios básicos requeridos para realizar la selección genómica fueron desarrollados (Figura 4).

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La línea de selección genómica fue seleccionada usando predicciones basadas en genotipos y estimaciones de los efectos del mercado. Esto resultó reduciendo el intervalo de generación aproximadamente a la mitad. Basándose en valores genómicos en criadores, los mejores animales fueron seleccionados como los padres de la siguiente generación. Cuando los fenotipos estuvieron disponibles, estos fueron adheridos al set de entrenamiento y los resultado de los datos de entrenamiento fueron reanalizados para usarse en la próxima generación. Las aves de la línea de producción genómica producen una nueva generación de aves cada 7 meses. Para reducir el costo de la genotipificación sin incrementar la expectativa de acumulación de endogamia por año, el tamaño de la población activa se redujo a 50 machos y a 50 hembras. Por el contrario la línea tradicional de fenotipo/ pedigrí fue seleccionada cada 13 meses, con 60 machos y 36 hembras empleadas para producir la próxima generación.

12 de los 16 rasgos medidos mostraron que la última generación de ponedoras de la selección genómica superó la selección de ponedoras de la línea de Fenotipo Tradicional. El progreso originó tanto una mayor precisión de los valores genéticos, como una rápida rotación de las generaciones. El análisis de los datos mostró que la precisión de los valores genéticos genómicos fue mayor en familiares directos de individuos que formaron parte del set de entrenamiento, por lo tanto el fenotipo sigue desempeñando un papel importante. Así, este proyecto demostró que la Selección Genómica podría aplicarse con éxito en la cría de aves de corral para mejorar la ganancia genética.

Implementación de la Selección Genómica en ponedoras

Con base en los resultados prometedores obtenidos en el experimento de selección, la selección genómica fue implementada por Hy-Line International en otras líneas de ponedoras. Modelos de Selección Genómica mostraron mejoras en la precisión en el análisis basado en pedigrí. De este modo, en 2013 inició la aplicación de la rutina desarrollada en la investigación de selección genómica, las primeras aves seleccionadas genómicamente generarán descendientes que entrarán al mercado como aves comerciales en 2015.

Referencias


Partes del documento se publicaron originalmente en WOLC, A., DEKKERS, J., SZWACZKOWSKI, T (2013):. Nowe Perspektywy genetycznego Doskonalenia drobiu. Polskie Drobiarstwo 8: 8-10.

WOLC, A., KRANIS, A., ARANGO, J ., et al. (2014): Aplicaciones de la Selección Genómica en aves de corral. En: Actas del 10º Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. 17 a 22 agosto de 2014. Vancouver, Canadá.

WOLC, A. (2014): Selección Genómica Entendimiento en Cría de aves de corral. Poultry Science Journal del Mundial 70:. 309-313 ANDREESCU, C., AVENDAÑO, S., BROWN, SR et al. (2007): El desequilibrio de ligamiento en las líneas de cría relacionados de pollos. Genética 177: 2161-2169.

AVENDAÑO, S., WATSON, KA, KRANIS, A. (2010): Genómica en aves de corral de cría: de la utopía a la entregables. En: Actas del 9º Congreso Mundial sobre Genética Aplicada a la Producción Ganadera, 1-6 de agosto de 2010. Leipzig, Alemania. 01.07 Sesión. http://www.kongressband.de/wcgalp2010/assets/pdf/0049.pdf Consultado el 16/05/2014. AVENDAÑO, S., WATSON, KA, KRANIS, A. (2012): Genómica en la cría de aves de corral - En las fases de consolidación. En: Actas del 24º Congreso Mundial de Avicultura: 5 hasta 9 agosto 2012. Salvador, Brasil. P.36.

AVIAGEN (2012): Aviagen incluye información genómica para el mejoramiento continuo de sus productos de engorde. Consultado el 10/07/2013. Briles, WE, PIEDRA, HA, COLE, RK (1977): la enfermedad de Marek: efectos de alloalleles histocompatibilidad B en líneas de pollo resistentes y susceptibles. Ciencia 195: 193-195. Dalloul, RA, LARGO, JA, Zimin, AV , et al. (2010): Multi-plataforma de secuenciación de próxima generación del pavo doméstico (Meleagris gallopavo): montaje y análisis del genoma. PLoS Biology 8: e1000475.

HAZEL, LN (1943): La base genética para la construcción de índices de selección. Genética 28: 476-490. HENDERSON, CR (1950): Estimación de parámetros genéticos. Biometría 6: 186. HENDERSON, CR (1976): Un método simple para calcular la inversa de una matriz de relaciones numerador utilizado en la predicción de los valores genéticos. Biometría 32: 69-83. Hy-Line International (2013): Hy-Line International invierte en el programa de expansión de varios años. Consultado el 10/07/2013 Meuwissen, EL, HAYES, BJ, Goddard, ME (2001): La predicción del valor genético total usando marcador mapas densos en todo el genoma. Genética 157: 1819-1829. MOROTA, G., ABDOLLAHI-ARPANAHI, R., KRANIS, A. , et al. (2014): predicción de rasgos de engorde Genoma habilitado en pollos mediante anotación genómica. BMC Genomics 15: 109. Neeteson-VAN Nieuwenhoven, AM, KNAP, P., AVENDAÑO, S. (2013): El papel de cerdo comercial sostenible y la cría de aves de corral para la seguridad alimentaria. Fronteras Animal 3: 52-57.

POWELL, JE, KRANIS, A., Floyd, J., et al. (2012): El uso óptimo de los modelos de regresión en los estudios de asociación del genoma. Genética Animal 43: 133-143. Quaas, RL (1976): Cálculo de los elementos de la diagonal inversa y de una gran matriz de relaciones numerador. Biometría 32: 949-953. Quaas, RL, POLLAK, EJ (1980) Metodología Modelo mixto de los programas de pruebas de ganado de la granja y de carne rancho. Journal of Animal Science 51: 1277-1287. WANG, C., Habier, D., Peiris, BL et al. (2013): La precisión de la predicción genómica utilizando una baja densidad panel de polimorfismo de un solo nucleótido uniformemente espaciadas en pollos de engorde. Poultry Science 92: 1712-1723.

WOLC, A., STRICKER, C., ARANGO, J. , et al. (2011): Cría de predicción de valor para los rasgos de producción en capas utilizando métodos basados ??pedigrí y marcadores. Genética Selección Evolución 43: 5.