Selección genómica en ponedoras y crías de pollos de engorde (Parte I)



Introducción

El desarrollo de la tecnología ha permitido una selección más precisa y eficiente de los animales, especialmente para las aves de corral. En las últimas décadas se ha implementado métodos estadísticos cada vez más complejos y exigentes, que evalúan el valor genético de un individuo empleando la información fenotípica y pedigrí.

Este artículo expone como la selección genómica se convierte en una extensión natural de los métodos empleados antiguamente y cómo ésta puede ser implementada para incrementar las mejoras genéticas en las aves de corral.


Selección en aves de corral


Durante los últimos 50 años, la selección genética en aves de corral ha demostrado ser todo un éxito, permitiendo incremento de huevos en ponedoras y un rápido crecimiento en carne de pollo de engorde. (Ver figura 1)

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Dicho progreso se ha logrado mediante la selección y reproducción de aves por encima del promedio, lo que resulta en el aumento de la frecuencia de los alelos favorables en la próxima generación. Ha medida que se desarrolla la tecnología y la capacidad computacional, diferentes métodos han sido empleados para determinar cuáles aves tienen alelos superiores. Tras el descubrimiento del ADN, como la molécula que almacena la información genética, métodos que buscan la variación en el ADN y caracterización del efecto de estas variantes en fenotipos (Rasgos Físicos) han sido de gran interés para los investigadores y criadores. Estudios relacionados con éste tema son llamados "búsquedas QTL"(Quantitative Trait Loci), los cuales han permitido el descubrimiento de múltiples regiones en el genoma, asociados con rasgos fenotípicos específicos.

Selección Genómica

La decodificación de la secuencia genómica reveló millones de lugares donde las aves difieren entre sí como un único nucleótido (polimorfismo de nucleótido único, SNP). Este logro permitió el desarrollo de métodos que permiten el rápido genotipado simultáneo de aves en miles de lugares del genoma, a un costo mucho menor por genotipo. Imputación

Adicional a los esfuerzos de sistematización, el principal reto de la selección genómica es el alto costo del genotipado. Esta inversión sólo puede verse justificada mediante un uso limitado en los padres, en las líneas puras de la que se genera el progreso genético. Dicho progreso genético, alcanzado en las líneas puras se transmite mediante los niveles de multiplicación en la estructura de la población en forma de pirámide (Figura 2 ), de tal manera que incluso pequeñas mejoras en las líneas puras, generan un gran impacto gracias al gran número de descendientes en el nivel comercial.

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Referencias

Partes del documento se publicaron originalmente en WOLC, A., DEKKERS, J., SZWACZKOWSKI, T (2013):. Nowe Perspektywy genetycznego Doskonalenia drobiu. Polskie Drobiarstwo 8: 8-10.

WOLC, A., KRANIS, A., ARANGO, J ., et al. (2014): Aplicaciones de la Selección Genómica en aves de corral. En: Actas del 10º Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. 17 a 22 agosto de 2014. Vancouver, Canadá.

WOLC, A. (2014): Selección Genómica Entendimiento en Cría de aves de corral. Poultry Science Journal del Mundial 70:. 309-313 ANDREESCU, C., AVENDAÑO, S., BROWN, SR et al. (2007): El desequilibrio de ligamiento en las líneas de cría relacionados de pollos. Genética 177: 2161-2169.

AVENDAÑO, S., WATSON, KA, KRANIS, A. (2010): Genómica en aves de corral de cría: de la utopía a la entregables. En: Actas del 9º Congreso Mundial sobre Genética Aplicada a la Producción Ganadera, 1-6 de agosto de 2010. Leipzig, Alemania. 01.07 Sesión. http://www.kongressband.de/wcgalp2010/assets/pdf/0049.pdf Consultado el 16/05/2014.

AVENDAÑO, S., WATSON, KA, KRANIS, A. (2012): Genómica en la cría de aves de corral - En las fases de consolidación. En: Actas del 24º Congreso Mundial de Avicultura: 5 hasta 9 agosto 2012. Salvador, Brasil. P.36. http://www.facta.org.br/wpc2012-cd/pdfs/plenary/Santiago_Avendano.pdf Consultado el 16/05/2014.

AVIAGEN (2012): Aviagen incluye información genómica para el mejoramiento continuo de sus productos de engorde. Consultado el 10/07/2013.

Briles, WE, PIEDRA, HA, COLE, RK (1977): la enfermedad de Marek: efectos de alloalleles histocompatibilidad B en líneas de pollo resistentes y susceptibles. Ciencia 195: 193-195.

Dalloul, RA, LARGO, JA, Zimin, AV , et al. (2010): Multi-plataforma de secuenciación de próxima generación del pavo doméstico (Meleagris gallopavo): montaje y análisis del genoma. PLoS Biology 8: e1000475.

HAZEL, LN (1943): La base genética para la construcción de índices de selección. Genética 28: 476-490.

HENDERSON, CR (1950): Estimación de parámetros genéticos. Biometría 6: 186.

HENDERSON, CR (1976): Un método simple para calcular la inversa de una matriz de relaciones numerador utilizado en la predicción de los valores genéticos. Biometría 32: 69-83.

Hy-Line International (2013): Hy-Line International invierte en el programa de expansión de varios años. Consultado el 10/07/2013

Meuwissen, EL, HAYES, BJ, Goddard, ME (2001): La predicción del valor genético total usando marcador mapas densos en todo el genoma. Genética 157: 1819-1829.

MOROTA, G., ABDOLLAHI-ARPANAHI, R., KRANIS, A. , et al. (2014): predicción de rasgos de engorde Genoma habilitado en pollos mediante anotación genómica. BMC Genomics 15: 109.

Neeteson-VAN Nieuwenhoven, AM, KNAP, P., AVENDAÑO, S. (2013): El papel de cerdo comercial sostenible y la cría de aves de corral para la seguridad alimentaria. Fronteras Animal 3: 52-57.

POWELL, JE, KRANIS, A., Floyd, J., et al. (2012): El uso óptimo de los modelos de regresión en los estudios de asociación del genoma. Genética Animal 43: 133-143.

Quaas, RL (1976): Cálculo de los elementos de la diagonal inversa y de una gran matriz de relaciones numerador. Biometría 32: 949-953.

Quaas, RL, POLLAK, EJ (1980) Metodología Modelo mixto de los programas de pruebas de ganado de la granja y de carne rancho. Journal of Animal Science 51: 1277-1287.

WANG, C., Habier, D., Peiris, BL et al. (2013): La precisión de la predicción genómica utilizando una baja densidad panel de polimorfismo de un solo nucleótido uniformemente espaciadas en pollos de engorde. Poultry Science 92: 1712-1723.

WOLC, A., STRICKER, C., ARANGO, J. , et al. (2011): Cría de predicción de valor para los rasgos de producción en capas utilizando métodos basados ??pedigrí y marcadores. Genética Selección Evolución 43: 5.